يكتشف نيو (كيانو ريفز) أنه بطريقة ما قادر على استخدام قوته في العالم الحقيقي، وأن عقله باستطاعته التحرر من جسده؛ ولذلك يجد نفسه إذ فجاة محاصرًا في محطة قطار ما بين العالم الحقيقي والماتركس. في أثناء كل هذا تستعد زيون (ريني ناوفاهو) لحرب شعواء ضد الماكينات رغم صعوبة فوز زيون بتلك الحرب. وبين هذا وذاك لا يعلم كلا الطرفين أن هناك طرفًا ثالثًا يسعى للقضاء على العالم كله.
خلاصة فيلم The Matrix Revolutions (2003):

The Matrix Revolutions هو الجزء الثالث والأخير من ثلاثية The Matrix، ويُختتم فيه الصراع الملحمي بين البشر والآلات.
القصة:

تبدأ الأحداث مباشرة بعد نهاية الجزء الثاني. نيو (Neo) الآن في حالة غيبوبة، لكنه في الواقع عالق في مكان غامض بين المصفوفة والعالم الحقيقي، يُعرف بـ محطة القطار. تُسيطر عليه هناك قوة تُدعى الميروفينجين (Merovingian). بمساعدة ترينيتي (Trinity) ومورفيوس (Morpheus)، يتم إنقاذ نيو ليعود إلى مهمته.

في الوقت نفسه، تستمر الآلات بحفر طريقها نحو زيون (Zion)، حيث يستعد البشر لمواجهة هجومية شرسة تهدد وجودهم.
المواجهة مع العميل سميث:

العميل سميث (Agent Smith) يصبح أكثر قوة وخروجًا عن السيطرة. سميث لم يعد مجرد عميل في المصفوفة، بل تحول إلى تهديد للبشر والآلات على حد سواء، حيث يسعى لتدمير كل شيء، بما في ذلك المصفوفة نفسها.

نيو يدرك أن القضاء على سميث هو المفتاح لإنقاذ المصفوفة والعالم الحقيقي. يقرر السفر إلى مدينة الآلات (Machine City) لعقد اتفاق مع الآلات: إذا قضى على سميث، فإن الآلات ستوقف الهجوم على زيون.
المعركة الكبرى:

في العالم الحقيقي: تدور معركة ضخمة بين قوات زيون وجيش الآلات. يقاتل البشر بشجاعة باستخدام الميكا وأسلحتهم الثقيلة، لكن الوضع يصبح حرجًا مع اختراق الآلات لدفاعاتهم.
في المصفوفة: يواجه نيو سميث في قتال ملحمي داخل المصفوفة. خلال القتال، يسمح نيو لسميث بأن "يندمج" معه، مما يؤدي إلى تدمير البرنامج الفاسد (سميث) من الداخل.

النهاية:

بعد القضاء على سميث، تضحي الآلات بحياة نيو. يُترك مصير نيو غامضًا، حيث يتم نقله بعيدًا بعد انتهاء مهمته.

في العالم الحقيقي، تتوقف الآلات عن مهاجمة زيون، ويتم تحقيق هدنة بين البشر والآلات. أما في المصفوفة، فتُعيد المرشدة (The Oracle) التأكيد على أن السلام قد تحقق، مع ترك الباب مفتوحًا لإمكانية مستقبل أفضل للبشر والآلات.
الرسالة:

The Matrix Revolutions ينهي السلسلة برسالة حول التضحية، الأمل، وإمكانية التعايش بين الكائنات المختلفة. الفيلم يترك النهاية مفتوحة للتأويل، مما يجعله موضوعًا للنقاش العميق بين المشاهدين